米中央情報局（CIA）がイランの最高指導者アヤトラ・アリ・ハメネイの動線を長期にわたり追跡し、指導部会合の時間と場所を特定した。それを踏まえ、米国とイスラエルが攻撃時点を電撃的に変更し、精密打撃に踏み切ったと伝わった。ドナルド・トランプ米大統領は、ハメネイが爆撃で死亡したと公式に確認した。
ニューヨーク・タイムズ（NYT）は1日（現地時間）、CIAが数カ月にわたりイラン最高位要人の移動経路を分析する中、28日土曜日の午前にテヘランの指導部コンパウンドで高位級会議が開かれるという決定的な情報を入手したと報じた。とりわけハメネイが直接出席する事実まで把握したとされる。
これにより、当初は夜間空爆を計画していた米国とイスラエルは、攻撃時間を土曜日の午前に変更した。標的となったのは大統領府と最高指導者執務室、国家安全保障会議が集まるイラン権力の中枢区域であった。
イスラエルは、当該会議にモハンマド・パークプールイスラム革命防衛隊（IRGC）総司令官、アジズ・ナシルザデ国防相、アリ・シャムハニ最高国家安全保障会議事務総長、マジド・ムサビIRGC航空宇宙軍司令官など軍・情報の首脳部が集結すると判断した。
作戦はイスラエル時間午前6時ごろ、長距離精密誘導兵器を搭載した戦闘機が出撃して始まった。約2時間5分後のテヘラン時間午前9時40分ごろ、長距離ミサイルが指導部コンパウンドを打撃した。当時、国家安全保障の首脳部はコンパウンド内の一棟に、ハメネイは近隣の別棟にいたと伝えられた。
イスラエル国防当局者は、テヘラン内の複数拠点を同時多発的に打撃し、そのうちの一カ所に政治・安全保障の最高位要人が集まっていたと明らかにした。イランが戦争に備えていたものの、戦術的奇襲に成功したとの評価も示した。
トランプ大統領はこの日、トゥルースソーシャルを通じ、ハメネイが爆撃で死亡したと述べた。イラン国営IRNA通信は、シャムハニ事務総長とパークプール司令官の死亡事実を確認した。
今回の作戦の背景としては、昨年6月に起きた「12日戦争」が取り沙汰される。当時、米国はイラン指導部と革命防衛隊の通信・移動方式に関する膨大な情報を蓄積したとされる。トランプ大統領が当時ハメネイの隠れ家を把握していたと言及したのも、こうした情報網に基づくものだとNYTは伝えた。
指導部コンパウンド空爆後に続いた後続攻撃では、イラン情報機関の首脳部の潜伏先も精密打撃を受けたとされる。ある関係者は、最上位の情報責任者は辛うじて避難したが、高位幹部陣は事実上壊滅状態に至ったと述べた。